Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms