Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5F1P24539 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms