Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms