Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF4P18085 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARF4P18085 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARF4P18085 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARF4P18085 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF4P18085 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF4P18085 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF4P18085 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARF4P18085 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms