Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPD1P17405 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms