Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEPDP12955 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEPDP12955 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms