Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GLI4P10075 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GLI4P10075 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms