Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HKR1P10072 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HKR1P10072 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms