Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGB3P0DN86 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGB3P0DN86 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms