Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L5P0DN76 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms