Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIMD1P0DJR0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms