Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms