Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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