Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSLP07711 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSLP07711 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSLP07711 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms