Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms