Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF2P04141 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms