Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGAP02671 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGAP02671 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGAP02671 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FGAP02671 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FGAP02671 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGAP02671 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms