Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG7O95352 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG7O95352 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG7O95352 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG7O95352 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG7O95352 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG7O95352 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG7O95352 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG7O95352 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG7O95352 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG7O95352 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms