Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIN3BO75182 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms