Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNSO60931 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNSO60931 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNSO60931 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms