Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms