Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNQ3O43525 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNQ3O43525 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNQ3O43525 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNQ3O43525 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNQ3O43525 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms