Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms