Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP290O15078 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP290O15078 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP290O15078 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP290O15078 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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