Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KRW8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KRW8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KRW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KRW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KRW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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