Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CCDC179H3BU77 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms