Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DGG1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DGG1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms