Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD1B0YJ81 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms