Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms