Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM149AA5PLN7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms