Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms