Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms