Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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