Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCQ9Y266 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms