Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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