Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD7AQ9UPZ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms