Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK2Q9UPX8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms