Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms