Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms