Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms