Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP21Q9UK80 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms