Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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