Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms