Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms