Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS29Q9UBQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS29Q9UBQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms