Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms