Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms