Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms