Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms