Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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